Méthodologie de travail

Pour atteindre les résultats attendus et pouvoir atteindre les objectifs proposés par ThinkGut, plusieurs actions ont été proposées :


 

Il s’agira de collecter les informations cliniques et biologiques relatives à l’interrelations entre microbiote-cognition et le développement de modèles d’analyse de biologie des systèmes dans le cadre de l’axe intestin-cerveau.

Cette action, centrée sur l’objectif biomédical, prévoit la création d’un référentiel anonyme transfrontalier qui, sur la base de données compilées auprès de plus de 1700 sujets, développera des modèles de biologie des systèmes multi-échelles de l’axe intestin-cerveau chez la souris et l’homme. La plupart des tâches associées à cette action sont réalisées par IDIBGI, avec l’appui de l’INSERM dans la collecte des données et le développement de modèles et d’Enterosys pour tout ce qui concerne l’exploitation des brevets de propriété intellectuelle issus de la base de données.

 

Création d’outils basés sur le microbiome pour la prévention, le diagnostic et le traitement des troubles neurocognitifs associés au vieillissement et à l’obésité.

Cette action, centrée sur la réalisation de l’objectif biotechnologique, vise à générer des outils diagnostiques-thérapeutiques basés sur le microbiome. Ces outils peuvent inclure des profils bactériens en tant que nouveaux biomarqueurs, l’identification de nouveaux modèles mathématiques qui offrent une interprétation clinique des biomarqueurs et des modèles chez des souris humanisées.

L’INSERM est en charge d’évaluer l’impact du microbiote sur les modèles animaux, de séquencer et quantifier l’ADN bactérien, et de définir de nouveaux profils de biomarqueurs. D’autre part, Enterosys est en charge des analyses cellulaires et moléculaires des neurones du système nerveux entérique, de l’axe intestina-cerveau dans les modèles animaux. IDIBGI travaillera avec les deux entités associées dans le phénotypage cognitif. Les résultats donneront lieu à un ou deux outils de prévention, de diagnostic et de traitement des troubles neurocognitifs associés au vieillissement et à l’obésité.


 

Formation de spécialistes inter/multidisciplinaires des interrelations microbiote-cognition sur le territoire transfrontalier.

Cette action, centrée sur la réalisation de l’objectif de formation, vise à former des spécialistes interdisciplinaires et multidisciplinaires de la relation entre microbiote et cognition sur le territoire où le projet est développé. Les cours et formations s’appuieront sur les solides connaissances et la vision scientifique et interdisciplinaire des instituts IDIBGI et INSERM. Ils auront également une perspective non académique, mettant l’accent sur une approche commerciale qui sera menée par Enterosys.

Pour mettre en œuvre l’objectif de formation du projet, au moins deux thèses de doctorat seront développées, codirigées par l’IDIBGI et l’INSERM, et deux séjours de recherche postdoctorale à l’IDIBGI et à l’INSERM, dont l’un sera également partiellement réalisé à Enterosys. Dans le même temps, au niveau universitaire, le projet ThinkGut impliquera également des étudiants universitaires de troisième cycle et de premier cycle effectuant des stages, des thèses, des maîtrises ou des mémoires de premier cycle. De même, le projet ThinkGut sera également diffusé lors de réunions d’information organisées par l’IDIBGI pour les programmes de lycée et de formation professionnelle.

Outre les actions mentionnées dans les paragraphes précédents, ThinkGut comprend également deux autres actions concernant les tâches de gestion de projet et de communication.

Fonds européen de développement régional

Le projet ThinkGut, cofinancé à 65% par le Fonds européen de développement régional (FEDER) à travers le programme Interreg V-A Espagne-France-Andorre (POCTEFA 2014-2020), dispose d'un budget total de 1.3 million d'euros.

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